直至 2016 年 6 月，臨床證實臍帶血可用作移植治療的疾病多達 113 種5,6，當中包括以下類別：
白血病（俗稱血癌）
急性白血病
- 急性淋巴性白血病的治療
- 急性骨髓性白血病
- 急性混合性白血病
- 急性未分化性白血病
慢性白血病
- 慢性淋巴球性白血病
- 慢性骨髓性白血病
- 慢性骨髓單核細胞性白血病
- 青少年慢性骨髓性白血病
- 青少年骨髓單核細胞性白血病
骨髓發育不良症候群
- 頑固性貧血
- 環形鐵粒幼紅細胞性難治性貧血
- 頑固性貧血併有芽母細胞過多
- 頑固性貧血併有芽母細胞過多且正轉化
- 慢性骨髓單核細胞性白血病
白血病（非特殊）
淋巴腫瘤
- 何杰金病李淋巴瘤（淋巴網狀細胞瘤）
- 非何杰金氏淋巴瘤（非霍奇金病淋巴瘤）
- 自身免疫性淋巴細胞增生綜合症
- 淋巴瘤（非特殊）
其他血細胞增殖疾病
貧血
- 先天性紅血球形成不良貧血
- 先天性角化不全症
- 范康尼氏貧血症
- 陣發性夜間血紅素尿症
- 舒一戴二氏綜合症
- 嚴重性再生不良貧血（非特殊）
- 鐵粒幼紅細胞性貧血
- 再生不良貧血
遺傳性紅血球細胞疾病
- 地中海型貧血
- 乙型地中海型貧血
- 純紅細胞再生障礙
- 純粹性紅血球再生不良
- 鐮狀細胞疾病
遺傳性血小板異常
- 巨核細胞缺乏/先天性血小板過少
- 血小板無力症
遺傳性複合性嚴重型免疫功能缺陷疾病
- 併線苷酸去胺酶缺乏
- X 連結嚴重型免疫功能缺陷疾病
- 併 T 細胞、B 細胞缺乏
- 併 T 細胞缺乏、B 細胞正常
- 歐門氏症候群
遺傳性免疫功能缺陷疾病 - 低白細胞數
- 柯士文症候群
- 先天性骨髓粒細胞缺乏症
- 先天性中性粒細胞減少症
骨髓增生性疾病
- 急性骨髓硬化症
- 不明原因的骨髓性（骨髓纖維化）
- 真性多血症
- 原發性血小板增多症
吞噬細胞疾病
- 薛迪克 - 東氏症候群
- 慢性肉芽腫病
- 中性白血球肌動蛋白缺乏症
- 網狀組織發生不全
血漿細胞異常
- 多發性骨髓瘤
- 漿細胞白血病
- 瓦爾登斯待倫巨球蛋白血症
細胞增殖疾病
- 家族性噬紅血球性淋巴組織細胞增生症
- 噬血症候群
- 噬血淋巴組織細胞瘤病
- 組織球增生症
- 蘭格罕細胞組織球增生症
遺傳性免疫系統疾病（所有治療為異體移植）
- 軟骨毛髮發育不全
- 先天性紅血球紫質缺乏症
- 哈布二氏症候群
- 皮爾遜綜合症
- 全身性肥大細胞增生症
遺傳性代謝疾病
黏多醣儲積症
- 黏多醣症
- 賀勒氏症
- 賀勒 - 施艾氏症
- 韓特氏症（粘多糖病之一型）
- 聖菲利波綜合症
- 莫基奧綜合症，黏多糖貯積症IV型
- 拉米氏症
- 黏多糖貯積症VII型
- 黏脂沈積症
白質退化症
- 腎上腺腦白質失氧症 / 腎上腺脊髓神經病變型
- 克拉伯病（嬰兒遺傳性腦白質萎縮）
- 異染性白質代謝不良退化症
- 佩利措伊斯 - 梅茨巴赫病(慢性兒童型腦硬化症)
溶小體肝醣儲積症
- 高雪氏症
- 尼曼克氏症
- 桑德霍夫病
- 戴薩克斯症
- 沃爾曼病
新陳代謝及儲積症
- 甲型甘露糖甘貯積症
- 澱粉樣變
- 天冬氨酰葡萄糖胺尿症
- 奧斯汀氏症
- 岩糖酵素缺乏症
- 神經節苷脂儲存症
- 幼兒原蠟樣脂褐質積存症
- 尼曼匹克氏症
- 涎酸酵素缺乏症
其他遺傳性疾病
- 萊一尼綜合症
- 大理石骨症
其他癌症
- 乳癌
- 成神經管細胞瘤
- 神經母細胞瘤
- 視網膜母細胞瘤
- 其他惡性腫瘤
其他疾病
- 表皮分解性水皰症（泡泡龍）
